- Santiago de Querétaro ( 626,495 )
- Benito Juarez ( 355,017 )
- Dolores Hidalgo Cuna de la Independencia Nacional ( 59,240 )
- Paraiso ( 23,830 )
- San Jerónimo Ixtepec ( 23,150 )
- Atlacomulco ( 22,247 )
- Santa Rosa Jauregui ( 17,091 )
- Doctor Arroyo ( 8,435 )
- Amatlán de los Reyes ( 7,634 )
- San Lorenzo Tlacotepec ( 7,566 )
- San Jerónimo de Juárez ( 7,326 )
- Coahuayana Viejo ( 6,848 )
- San José el Alto ( 5,957 )
- Santiago Acutzilapan ( 5,866 )
- Tlacote el Bajo ( 5,419 )
- Atoyac ( 5,359 )
- Nieves ( 5,296 )
- Mazatepec ( 4,975 )
- San Antonio Enchisi ( 4,870 )
- Hueyotlipan ( 4,798 )
- El Salitre ( 4,408 )
- Nueva Ciudad Guerrero ( 4,384 )
- San Pedro del Rosal ( 4,277 )
- Agua Verde ( 4,192 )
- Paraje Nuevo ( 4,190 )
- El Bosque ( 4,158 )
- Montenegro ( 3,844 )
- Calnali ( 3,600 )
- Santa María del Oro, Nayarit ( 3,596 )
- Colinas de Santa Cruz Segunda Sección ( 3,326 )
- Tecoac (Santa María Nativitas) ( 3,175 )
- Santa Cruz Bombatevi ( 2,843 )
- San Jerónimo de los Jarros ( 2,555 )